本文目录

1. 菌的进化树构建有啥用
2. mega7绘制进化树如何设置显示进化距离
3. 进化树的标尺怎么设置
4. 进化树的构建方法

菌的进化树构建有啥用

用于简明地表示生物的进化历程和亲缘关系。进化树就是，生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近，把各类生物安置在有分枝的树状的图表上。

mega7绘制进化树如何设置显示进化距离

在mega7中绘制进化树时，设置显示进化距离需要在“距离”选项卡中选择“进化距离”并设置距离类型和计算方法。

可以选择多种距离类型，如Jukes-Cantor距离、Kimura2参数距离等，也可以选择不同的计算方法，如最大似然法、最小进化法等。

设置完成后，进化树上将显示每个节点之间的进化距离。

进化树的标尺怎么设置

进化树怎么标距离:(1)水平方向：遗传变量的变化程度水平方向上的分支代表进化谱系随着时间的变化，分支长度越长表示该分支对应物种的变化越大。

(2)标尺：底部的短线标尺下部的数字0.07指该长度的分支代表基因组的遗传变异度为0.07。其中，遗传变异度通常表示基因组中每个位点碱基的替换频率，计算公式为：变异度=变异碱基数/总碱基数(%)。

通常情况下会以百分比的方式展示，进而可解释为每100个碱基位点的变异度。

(3)垂直方向:无特别含义

进化树的构建方法

工具/原料

电脑

MEGA软件

方法/步骤

1、在NCBI上搜索所需的目的序列。

2、以Metallothionein（MT）为例，将所需目的序列复制到Word上，形成如图格式。

3、下一步用MEGA7构建进化树。首先打开MEGA，然后点击Align,点击Edit/BuildAlignment,然后在弹出的小框中选择Createanewalignment,点击OK，根据你的需求选择Protein或DNA，如果比对的是核酸则点击DNA，若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。

4、点击Protein,出现如下第一张图所示，然后将目的序列粘贴。

5、点击Date菜单中的PhylogenticAnalysis点击Yes，然后在主菜单中点击Analysis,点击Phylogeny并选择第二个。点击YES，然后在弹出的框中点击compute。

6、下图即为所构建的进化树。

OK，关于进化树的构建方法和进化树怎么弄好看的内容到此结束了，希望对大家有所帮助。